Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HES3Q5TGS1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms