Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms