Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms