Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SAMD9Q5K651 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMD9Q5K651 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms