Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TDRD12Q587J7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms