Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms