Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00303Q3SY05 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms