Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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