Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL24A1Q17RW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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