Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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