Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PTPRNQ16849 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRNQ16849 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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