Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LAMA3Q16787 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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