Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FXNQ16595 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FXNQ16595 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXNQ16595 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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