Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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