Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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