Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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SIX1Q15475 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SIX1Q15475 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SIX1Q15475 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SIX1Q15475 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SIX1Q15475 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SIX1Q15475 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SIX1Q15475 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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