Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
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PTPRKQ15262 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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PTPRKQ15262 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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PTPRKQ15262 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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PTPRKQ15262 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
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PTPRKQ15262 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
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PTPRKQ15262 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
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PTPRKQ15262 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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