Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms