Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
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