Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms