Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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