Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms