Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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UBE4AQ14139 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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UBE4AQ14139 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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