Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL9A2Q14055 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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