Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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