Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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DDX39BQ13838 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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DDX39BQ13838 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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DDX39BQ13838 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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DDX39BQ13838 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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DDX39BQ13838 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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DDX39BQ13838 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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