Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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