Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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