Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms