Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
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