Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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