Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE3BQ13370 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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