Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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