Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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