Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
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