Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms