Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms