Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GTF3C1Q12789 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GTF3C1Q12789 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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