Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms