Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms