Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms