Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms