Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms