Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB1P82279 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms