Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms