Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABP4P57796 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABP4P57796 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABP4P57796 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms