Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV3P56539 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV3P56539 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAV3P56539 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAV3P56539 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms