Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms