Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms