Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms